1.脑部及神经系统并发症：神经系统受到损害时，可并发脑脊髓膜炎、脑炎、颅神经炎、运动和感觉神经炎，亦可发生舞蹈病、小脑共济失调、脊髓炎。

　　2.心脏广泛受累时，可出现急性心肌心包炎(指发生在心包的脏层和壁层的急性炎症，可同时合并心肌炎和心内膜炎。本病大都继发于全身性疾病，临床上以非特异性、结核性、化脓性、风湿性心包炎较为常见。另外，心肌梗塞、尿毒症和肿瘤等引起的心包炎也较常见。)。

　　3.关节并发症：关节致残、血管翳形成、骨与软骨侵蚀。

　　4.眼睛并发症：虹膜炎、甚至全眼炎而导致视力丧失。

　　5.其他并发症：还可见到闭塞性动脉内膜炎;

　　晚期，罕见慢性神经病变还有横贯性脊髓炎(transverse myelitis)、弥漫性感觉性轴突神经病、CNS髓鞘脱失性损害等。