鉴别诊断疾病较多，确诊主要依靠真菌检查。
结核病：是由结核杆菌感染引起的慢性传染病。
肝脓肿：由溶组织阿米巴原虫或细菌感染所引起。
腹膜后感染与脓肿：常见的病原体是大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、普通变形杆菌、产气杆菌及链球菌。
骨髓炎：由需氧或厌氧菌、分枝杆菌、真菌引起。
真菌性足菌肿：由真菌或放线菌引起的慢性肉芽肿疾病。
其他如：阑尾炎，葡萄状菌病，奴卡菌病等.
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