混合性厌氧菌感染主要与需氧菌相鉴别，通过细菌培养可资鉴别。普通培养只有一种细菌生长但直接涂片可见两种或以上细菌者，可考虑患者为混合感染。

　　厌氧菌感染：绝大多数属内源性。这些细菌是一种条件致病菌，必须在全身或局部抵抗力下降时才能发生侵入和感染。厌氧菌的鉴定可选用API 20A、VITEK-ANI、MICRO-01D、气液色谱仪等设备鉴定。厌氧菌的药敏试验大部分实验室采用美国临床实验室标准化委员会(NCCLS)推荐的琼脂稀释法。