需要与其他厌氧或需氧性细菌，包括肠杆菌和类杆菌，链球菌和葡萄球菌属鉴别

　　厌氧性链球菌或葡萄球菌感染：涂片显示大量的多形核白细胞和大量呈链状排列的球菌。

　　某种肠杆菌或类杆菌感染：涂片发现大量的革兰氏阴性杆菌。

　　肉毒杆菌感染：测定伤口或血液中的特异性抗原毒素。

　　几种常见梭菌

　　破伤风梭菌

　　破伤风，潜伏期为几天到几周，典型的表现为肌肉活动的兴奋与抑制失调，造成的苦笑面容和角弓反张等临床表现。

　　产气荚膜梭菌

　　1)气性坏疽：该病多见于战伤，也见于平时大面积创伤的工伤、车祸等。

　　2)食物中毒：主要由A型产气荚膜梭菌污染食物(多为肉类食品)而引起。

　　3)坏死性肠炎：由C型菌株污染食品所致。表现为肠麻痹坏死，死亡率较高。

　　肉毒梭菌

　　1)食物中毒: 由于肉毒梭菌芽胞污染食品。

　　2)创伤感染中毒：伤口感染到肉毒梭菌。

　　3)婴儿肉毒： 因食入被肉毒梭菌芽胞污染的食品(如蜂蜜)后发生中毒。