应与新生儿感染性疾病，如败血症、颅内感染等相鉴别，须注意上述疾病可发生血行播散，造成泌尿系感染。依赖对本症的高度警惕和相应的实验室检查确诊。

　　年长儿泌尿道感染症状与成人相似，尿道刺激症状明显，常是就诊的主诉。如能结合实验室检查，可立即得以确诊。但对婴幼儿、特别是新生儿，由于排尿刺激症状不明显或缺如，而常以全身表现较为突出，易致漏诊。

　　故对病因不明的发热患儿，都应反复作尿液检查，争取在用抗生素治疗前进行尿培养，菌落计数和药敏试验。凡具有真性菌尿者，即清洁中段尿定量培养菌落数≥105/毫升，或球菌≥103/毫升，或耻骨上膀胱穿刺尿定性培养有细菌生长，即可确立诊断。

　　完整的泌尿道感染的诊断，除了评定泌尿系被细菌感染外，还应包括以下内容：①本次感染是初发、复发或再感染;②有无尿路畸形，如膀胱输尿管反流、尿路梗阻等，如有膀胱输尿管反流，还要进一步了解“反流”的严重程度和有无肾脏疤痕形成;③确定致病菌的类型并做药敏试验;④感染的定位诊断，即上尿路感染或下尿路感染。需与肾小球肾炎、肾结核及急性尿道综合征鉴别。

　　1)肾小球肾炎急性肾炎初期可有轻微尿路刺激症状，尿常规检查中红细胞增多，有少数白细胞，但多有管型及蛋白尿，且多伴浮肿及高血压、尿培养阴性有助鉴别。

　　2)肾结构多见于年长儿。有结构接触史及结核感染中毒症状，结核菌素试验阳性。如病变累及膀胱可出现血尿、脓尿及尿路刺激症状，尿液中可查到结核杆菌，静脉肾盂造影可见肾盂肾盏出现破坏性病变。