变应性结膜炎应与下列疾病进行鉴别诊断：

　　1.干眼综合征 变应性结膜炎特别难以与干眼综合征相鉴别，因为两种疾病都存在间歇性加重的轻度结膜血管扩张和烧灼感。在变应性眼病的症状中很少有异物感，但在干眼症则很常见。干眼患者有发生变应性结膜炎的趋向，原因是泪液在结膜表面的稀释和冲洗变应原的能力受到了破坏。眼睑炎、睑板腺肿大和睑缘炎可能与葡萄球菌感染和(或)皮脂溢有关。与眼睑炎相关的症状和体征有烧灼感、眼睑红斑、结膜充血、泡沫状泪膜、眼睑秕糠和睑缘碎屑等。

　　2.感染性结膜炎 无季节性，睡醒时较重。早晨起床时，睫毛和眼睑常常粘在一起。其分泌物为浆液性和脓性不等。致病菌包括淋病奈瑟菌、脑膜炎奈瑟球菌、肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、葡萄球菌属、莫拉菌、衣原体和病毒。结膜刮片显示上皮细胞浆内嗜碱性包涵体是衣原体感染的特征。相反，变应性结膜炎通常有季节性，分泌物多呈黏丝状或黏稠状，细菌培养阴性。

　　3.春季角结膜炎 是一多发于小年龄组(8～20岁)的疾病，主要表现为严重的痒感、烧灼感和黏性分泌物。上睑结膜有巨大乳头和铺路石样乳头。可涉及角膜，但盾形溃疡并不常见。

　　4.特应性角结膜炎 可发生于各年龄组，常伴有严重的并发症。临床症状和体征为伴随严重痒感和烧灼感的慢性渗出性结膜炎。临床检查发现：睑缘增厚、角膜病变(包括血管翳、角膜炎和溃疡)和慢性红眼。常伴随圆锥角膜、囊下和极性白内障，以及易发葡萄球菌和单纯疱疹病毒感染。同时伴有特应性皮炎，特别是眼睑皮肤和眼附属器的炎症。

　　5.巨乳头结膜炎 多发生于配戴接触镜或义眼的人群。暴露的缝线也可诱发该病。翻转上眼睑可显示与接触镜、义眼或缝线位置相对应的巨大滤泡。其症状包括充血、烧灼感、痒感和黏性分泌物。

　　6.接触性变应性结膜炎 接触性变应性结膜炎的急性期特征为红斑、结膜水肿、眼睑硬结和水肿。该反应属于Ⅳ型细胞介导性迟发型超敏反应。在慢性期表现为眼睑的壳状化和地衣化。受累区多为与毒性物质相接触的区域。对美容物品或眼科药品的致敏是常见的致病原因，如局部用新霉素、阿托品和防腐剂等。在个别病例会发生上皮缺损、角膜混浊和角膜炎等并发症。