以手术切除肉芽肿或脓肿为主，术后辅以药物治疗。药物有：

　　1.二性霉素B：对隐球菌、球孢子菌、念珠菌等效果较好。剂量从0.25mg/kg开始，溶于5%葡萄糖溶液中静脉点滴，逐渐增至1mg/kg，使在3个月内总剂量达2～4g.滴注速度应缓慢，避光。由于本药不易透过血脑屏障，故常同时鞘内给药。方法：取二性霉素B0.25mg溶于等渗盐水1ml内，然后用5～10ml脑脊液再稀释后缓慢、分次注入鞘内。一般鞘内给药1次最大剂量为1mg，每周注射2次。应用本药前给予地塞米松和非乃根等，可减轻药物反应。

　　2.制霉菌素：对隐球菌、念珠菌等效果较好。剂量：成人200～400万U/d，儿童12.5～25万U/次，分2～4次口服。

　　3.克霉唑（三苯甲咪唑）：对念珠菌、球孢子菌等有效。剂量：成人天天50～60mg/kg，儿童天天20～60mg/kg，分3次口服。

　　4.曲古霉素：对隐球菌、芽生菌、念珠菌有效。剂量：20～40万U/d，分3～4次口服。

　　5.5-氟胞苷：作用同二性霉素B，但它能通过血脑屏障，对肝、肾均有损害。剂量：天天100～200mg/kg，一般应用6～8周。

6.抗生素：大剂量青霉素、林可霉素、氯霉素对放线菌感染有效。

7.Ketoconazole：对球孢子菌、组织胞浆菌有效。剂量：200～1200mg/d.

上述药物应用的期限视病情而定，并应根据脑脊液常规，生化，涂片检查和培养结果决定是否停药。用药期间要注重药物的副作用，并调整全身情况，增强机体反抗力，消除引起真菌感染的原因，这样才易于提高治疗效果。