（一）男性衣原体性尿道炎又称为非淋菌性尿道炎（NGU）是由衣原体感染引起的非急性化脓性尿道粘膜炎性病变

本病潜伏期比淋病长约1-3周或数月主要表现为尿道内不适刺痛及烧灼感并伴有不同程度的尿频尿急尿痛尿痛较淋病为轻尿道口轻度红肿并有浆液或粘液脓性分泌物稀薄而量少长时期不排尿或早晨首次排尿前可见尿道口分泌物污染内裤并可见尿道口有“糊口”现象;分泌物少时于晨起挤压尿道才流出少量粘液

沙眼衣原体感染易并发附睾炎表现为附睾肿大变硬及触痛多为单侧部分患者的抗沙眼衣原体抗体升高可直接从附睾抽吸液中分离出沙眼衣原体;累及睾丸可出现睾丸炎表现为睾丸疼痛触痛阴囊水肿及输精管变硬变粗;累及前列腺时可出现后尿道会阴及肛门部位钝痛或触痛可有性功能障碍直肠镜检可触及有压痛的前列腺如前列腺明显肿大可压迫后尿道而出现尿流变细排尿无力及尿流中断等;本病还可以合并Reiter综合征即关节炎结膜炎尿道炎三联症

（二）女性生殖系统衣原体感染症

女性感染衣原体不限于尿道可累及整个泌尿生殖器官此类感染常因缺乏自觉症状或症状轻微而忽视了治疗造成传染源而扩散形成危害

女性衣原体感染比男性感染引起的症状要多其主要感染部位为宫颈其后遗症多导致不孕症。