肛门直肠疾病是指一切与肛门直肠有关的疾病，常见的有痔、肛隐窝炎、肛裂、肛痈(肛门直肠周围脓肿)、肛漏(肛瘘)、脱肛、息肉痔(直肠息肉)及锁肛痔(肛管直肠癌)等，中医文献统称为痔疮、痔瘘。肛门直肠为消化道的末端，是通于体外的出口。

直肠起源于内胚层，而肛管则起源于外胚层形成的原肛，由于两者起源不同，所以在血液供应、神经支配、内衬上皮上也各不相同，故齿线作为其分界，是临床上重要的标志。

直肠上端在第二骶椎平面与乙状结肠相接，向下沿骶尾骨前面下行，终于齿线与肛管连接，全长约0.8cm。直肠上部与骶骨曲度一致形成骶曲，同时由于直肠腔大小在上端与乙状结肠同，下端则扩大为直肠壶腹，而壶腹前壁向前膨出，与肛管几成直角形成会阴曲。此二曲为乙状结肠镜检查时必须注意的解剖特点。肠管上1/3前面与两侧为腹膜所遮盖，中1/3前面腹膜向前反折成为直肠膀胱或直肠子宫陷凹，直肠下1/3完全在腹腔之外。肠壁肌层与结肠相同，在下部肥厚成为肛门内括约肌。直肠黏膜较厚，有3个半月形的皱襞，内有环肌纤维，称为直肠瓣。

肛管长约5cm，其外端为肛门，上端与直肠相连接，周围有内、外括约肌环绕。肛管的表层覆以肛管皮肤，在直肠黏膜与肛管皮肤交界处黏膜呈6～10个纵行皱折，称为直肠柱或肛柱。两个直肠柱下端之间有半月形黏膜皱襞，称为肛门瓣；肛门瓣与直肠柱之间的肠壁黏膜形成向上开口的袋状间隙，称为隐窝或窦。隐窝底部有肛腺体的导管开口。肛腺较集中于肛管的后壁，呈分支状，一般在黏膜下，但部分分支可穿通肛管周围组织，因此肛门直肠周围脓肿的发生与肛腺的感染化脓有关。上述结构使直肠黏膜与肛管皮肤之间形成一条不整齐的界线，称为齿线。齿线上有2～6个三角形乳头状突起，称为肛乳突。