外科手术切除。对早期局限性病灶，可采用局部病灶切除法。如果是深部组织病灶，切除范围要广泛，以免留有遗患。

　　X线辅助治疗。X线辅助治疗能有效的防止皮肤外伤，避免感染。

　　药物治疗。

　　系统性感染：可以用两性霉素B静脉滴注。肺足菌肿可用0.3%球红霉素溶液气雾吸入治疗。而放线菌和奴卡菌引起的足菌肿的治疗则可用抗生素或磺胺类药物。

　　局部病灶：足菌肿局部病灶可采用每毫升含1-2mg的两性霉素B溶液进行局部注射治疗。

　　真菌性足菌肿也可选用伊曲康唑和氟康唑，疗程至少3个月。

　　星形诺卡菌，可用青霉素G联合复方磺胺甲口恶唑治疗。

　　巴西奴卡氏菌，可用青霉素G联合复方甲基异唑治疗。

　　可视情况采用外科手术结合药物治疗。