(1) 感染性因素：现代医学认为，感染是引起本病的主要原因。

(2) 医源性因素：临床上属医源性引起的肛门直肠周围脓肿也不少见。

(3) 手术后因素：临床上亦可见到肛门直肠手术引起感染，而形成的直肠周围脓肿，以及尿道术后感染、会阴部术后感染、产后会阴破裂缝合后感染、尾骶骨骨髓炎术后感染等引起的脓肿。

(4) 其它：如枪、刀伤，直肠内异物损伤后感染，性病淋巴肉芽肿，放线菌病，直肠憩室炎感染，肛管直肠癌破溃或波及深部的感染，及身体虚弱，抵抗力低下，或患有慢性消耗性疾病，或营养不良，都是肛门直肠周围脓肿的发病原因。

形成肛周脓肿的常见原因主要是肛裂、大便干燥或用力排便等引起肛管直肠内微小损伤，肠道内细菌可经过损伤处的肛腺浸入到肛管直肠周围间隙而形成感染，进而形成脓肿。如果脓肿的位置较深，则可能有发热、乏力等全身症状，肛周部的疼痛红肿往往不太明显。

肛管直肠周围脓肿一般不能自行痊愈，如任其发展，最终脓肿将向肛周皮肤或肛管直肠腔内破溃形成肛瘘，如果脓液得到引流，症状可暂时缓解，随后破溃口可愈合，脓液又不断积聚，感染向周围继续扩散，再次出现症状，并可能出现新的脓肿，并形成多个破溃口，如此反复发作，经久不愈。

所以，一旦出现肛管直肠周围脓肿应及时治疗，少数肛周表浅的脓肿可采用抗生素治疗、热水坐寓局部理疗等方法消散，但多数患者需要手术切开脓肿，充分引流脓液，防止其不断扩散，以减轻疼痛等症状。

伴有肛瘘的肛管直肠周围脓肿，要根治必须先处理肛瘘，局部可用高锰酸钾溶液坐浴，使会阴保持清洁。同时应用抗生素控制感染，待脓肿破溃或切开引流后3个月左右，肛瘘周围炎症即会消退，纤维管道形成，再手术治疗肛瘘。