下丘脑生成促甲状腺激素释放激素，垂体生成促甲状腺激素，甲状腺生成甲状腺激素(T3、T4)。促甲状腺激素释放激素促进促甲状腺激素的生成，促甲状腺激素促进T3、T4的生成。当下丘脑发生病变，促甲状腺激素释放激素生成减少，引起促甲状腺激素生成亦减少，随后T3、T4生成亦减少；或当垂体发生病变，促甲状腺激素生成减少，引起T3、T4生成减少。因此，当下丘脑或垂体发生病变，最后可以使甲状腺生成甲状腺激素减少，引起甲状腺功能减退。也就是说，下丘脑或垂体的病变引起的甲减称为继发性甲减。