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本病在不同病期，应与不同的疾病相鉴别。早期应与下列疾病相鉴别：初期梅毒、生殖器疱疹、软下疳、腹股沟肉芽肿以及其他原发性或继发性感染等。出现淋巴结病时除了应与上述疾病鉴别外，尚应考虑到恶性肿瘤(淋巴瘤、转移癌)和其他感染性疾病如猫抓病、结核病、单核细胞增多症、土拉菌病等。晚期肛门直肠病变应与腹股沟肉芽肿、痔、尖锐湿疣、化脓性汗腺炎、溃疡性和炎症性结肠疾病、丝虫病以及肛门和直肠癌等鉴别。

1.有不洁性交史，潜伏期7-10日。

2.早期为外生殖器水疱，糜烂与溃疡，1-4周后可见腹股沟淋巴结肿大，男性有“槽沟征”，多数瘘管似“壶状”，愈后有瘢痕。女性可发生直肠周围炎，晚期出现象皮肿及直肠狭窄。

3.发生淋巴结时，可有寒战、高热及关节痛等全身症状。

4.病理改变为淋巴结有星状脓肿。

5.补体结合试验于感染4周后呈阳性反应，滴度1：64以上。

6.组织培养，可分离出衣原体(L1，L2及L3血清型)。

7.PCR检测衣原体DNA阳性。