临床上应与类鼻疽、孢子丝菌病、链球菌蜂窝织炎、葡萄球菌感染及播散性结核病等鉴别。本病与其他病原引起的疾病主要通过病原学检查来鉴别，通过病原学检查从病原的形态学特点做出鉴别。但鼻疽病与类鼻疽病无论是发病症状还是形态学特点都很相似，所以鉴别较难，两种病菌的不同点是鼻疽伯克霍尔德菌无鞭毛，类鼻疽伯克霍尔德菌具鞭毛;鼻疽伯克霍尔德菌可分解左旋木糖，类鼻疽伯克霍尔德菌则不分解。
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