小儿乙型肝炎病毒相关肾炎需与其他病因所致肾炎相鉴别，如系统性红斑狼疮肾炎、链球菌感染后肾小球肾炎等。

　　系统性红斑狼疮肾炎：系统性红斑狼疮(SIE)是一种侵犯全身结缔组织的自身免疫性疾病，全身器官特别是肾脏常被累及。SLE合并肾脏病变的发生率国外报道为16-80%，我国报道为64-67%.系统性红斑狼疮性肾炎(简称“狼疮性肾炎”)的诊断标准是在SLE确立后，临床上具有持续蛋白尿在(十)以上或镜下血尿(>10RBC/高视野)、管型尿和肾功能损害之一者。本病常有系统性红斑狼疮的各种临床表现，如发热。蝶形红斑、关节痛等。一般当肾脏被累及时其他脏器的损害也比较显著，其中心脏、胸膜及造血系统尤为显著。系统性红斑狼疮性肾炎系患者免疫功能异常，自身调节紊乱所致，脱氧核糖核酸和抗脱氧核糖核酸抗体形成的免疫复合物沉着于基膜内皮是狼疮性肾炎的重要病理基础，肝功能一般正常。

　　链球菌感染后的急性肾小球肾炎：典型病例于咽峡部、皮肤等处链球菌感染后发生水肿、血尿、蛋白尿等症状，诊断多无困难。一般链球菌感染后急性肾小球肾炎的诊断至少以下列三项特征中的两项为依据：①在咽部或皮肤病变部位检出可致肾炎的M蛋白型β溶血性链球菌A组;②对链球菌胞外酶的免疫反应-抗链球菌溶血素“O”(ASO)、抗链球菌激酶(ASK)、抗脱氧核糖核酸酶B(ADNAaseB)、抗辅酶Ⅰ酶(ANADase)、抗透明质酸酶(AH)，有一项或多项呈阳性，咽部感染后ASO增高，皮肤感染后AH、ADNAase和ANADase反应阳性;③C3血清浓度短暂下降，肾炎症状出现后8周内恢复正常。