小室间隔缺损因为分流量小而不产生任何症状，生长、发育也正常。但局部体征明显，于胸骨左缘第 3 ～ 4 肋间，可闻及Ⅲ /6 级以上粗糙的全收缩期杂音，伴有震颤。肺动脉瓣第二音正常或稍增强。
    中等大或巨大室间隔缺损，分流量较大或巨大，往往出现临床症状，包括心悸、呼吸困难、活动耐力减低、易罹呼吸道感染，表现发热、咳嗽、咳痰及肺部罗音。婴幼儿喂养困难，多汗及生长发育滞后，体质瘦弱。严重者常有显著的呼吸窘迫、肺部湿罗音、肝脏肿大等左、右心衰竭征象。局部体征除上述杂音外，常有心尖区搏动增强及范围扩大。由于肺血流量大，舒张期流经二尖瓣的血流增多而致相对性二尖瓣狭窄，心尖区出现舒张期杂音。
    干下型室间隔缺损，震颤与杂音位于胸骨左缘第 2 ～ 3 肋间。
    重症肺动脉高压者，由于肺血管阻塞性病变，阻力明显增高，使通过室间隔缺损的分流量显著减少，体表的震颤消失，收缩期杂音变得柔和，甚至可能完全消失，心尖区舒张期杂音消失。肺动脉第二音高亢，甚至可扪及拍击感，有时可闻及相对性肺动脉瓣关闭不全的 Graham-Steell 杂音。
    当肺动脉高压进一步加重时，肺血管阻力可等于或大于体循环阻力，通过室间隔缺损为双向分流或右向左分流为主，则表现有静息紫绀，伴有明显的右室肥大及右心衰竭，如颈静脉怒张、肝脏肿大、腹水、下肢浮肿等。临床上称艾森曼格 (Eisenmenger) 综合征，为室间隔缺损修补术的禁忌证。