1.血常规：白细胞升高，部分患者减少，分类正常或核左移，嗜酸性粒细胞增加，淋巴细胞绝对值减少。
 
    2.动脉血气分析：示低氧血症和呼吸性碱中毒。
 
    3.痰、支气管灌洗液及纤支镜肺活检：找到卡氏肺囊虫的包囊或滋养体。
 
    4.胸部X线检查：早期典型改变为双侧肺门周围弥漫性渗出，呈网状和小结节状影，然后迅速进展成双侧肺门的蝶状影，呈肺实变，可见支气管充气征。随病情进展呈弥漫性斑片状，也可融合成大片均匀致密阴影，其间有局灶性肺不张、肺气肿或肺大泡。
    
    5.90%患者枸橼酸镓、二乙烯三胺乙酰酸锝和多克隆免疫球蛋白铟肺显像显示异常，因此可作为卡氏肺囊虫性肺炎的诊断筛选，但特异性差。