在治疗原发病，增强免疫力，去除易患因素后，轻症病人可自然好转；有免疫抑制者可给两性霉素B 5～10mg 加入蒸馏水10ml 雾化吸入，每天2～3 次；或口服酮康唑0.2～0.4/d。病情较重者用氟康唑200mg/d，静脉滴注，疗程2～4 周或视病情而定。对合并菌血症、疑有血源播散，首选两性霉素B 每天0.4mg/kg，静脉滴注，总量1～1.5g。病情凶险或有休克宜尽快加大剂量，以达到最大耐受剂量，并合用氟胞嘧啶(5-氟胞嘧啶)每天50～100mg/kg，以提高疗效，减缓耐药产生。氟康唑、依曲康唑也有满意疗效，常用于不能耐受两性霉素B或治疗失败者。近来主张对长期粒细胞低下或骨髓抑制患者应用氟康唑400mg/d或两性霉素B 0.5mg/kg， 2 次/周，可有效预防播散性念珠菌病。