IBS的诊断是根据大便特征,疼痛时间和特点,并通过体检和常规诊断性检验排除其他疾病后方能确立.标准化的IBS诊断标准已被确定.IBS罗马标准包括排便后缓解的腹痛,大便频度或性质的改变,腹胀或粘液.诊断的关键是病史的有效获取,应注意直接地,非强制性地对现有症状,病史,过去治疗史,家族史,家庭成员的关系,药物和饮食史进行描述.患者对私人问题的解释和患者总体情绪状态也是同样重要的.医患关系的好坏是决定诊断和治疗效果的关键.

    在体检时,IBS患者一般呈健康状态.腹部触诊可有压痛,尤其是左下腹,有时可能有压痛的乙状结肠.所有患者都需进行肛指检查,对女性应作盆腔检查.

    应作大便隐血检查(最好为期三天连续进行).若无相关的旅游或症状(如发热,血性腹泻,严重腹泻的急性发作)的支持,极少需进行常规虫卵或寄生虫检查或大便培养.

应    进行纤维直肠乙状结肠镜检查.乙状结肠镜伸入和注入空气经常会诱发肠痉挛和疼痛.IBS患者的粘膜和血管常正常.在慢性腹泻患者,尤其是年龄较大的妇女中,粘膜活检可排除是显微镜下的结肠炎,其有两种类型：胶原性结肠类,三色染色显示粘膜下胶原沉积；淋巴细胞性结肠炎,粘膜淋巴细胞数增加.这些患者的平均年龄是60~65岁,女性多见.与IBS相同,表现为非血性水样腹泻,可通过直肠粘膜活检进行诊断.