基因是遗传信息的携带者，蛋白质是生命功能的执行体。人类细胞内含有的蛋白质种类估计有100万～1000万种，目前研究者只测定了其中一小部分蛋白质的序列。蛋白质组学是对特定细胞、组织或器官所包含的蛋白质的系统研究，是以基因组编码的所有蛋白为研究对象，从细胞及整体水平上研究蛋白质的组成及其变化规律，从而深入认识有机体的各种生理和病理过程。

肿瘤蛋白质组学是指对正常组织与疾病组织之间差异表达的蛋白质的鉴定和定量分析。一个细胞由非疾病状态转变为肿瘤的过程中，细胞内蛋白质表达谱会发生一系列显著的变化，使用蛋白质组分析技术能够从细胞整体水平上显示出这种变化，为寻找特异的肿瘤早期诊断生物标志物带来了希望。

蛋白质组学技术主要用于蛋白质的分离和鉴定。二维聚丙烯酰胺凝胶电泳、质谱技术和生物信息学是最常用的三大技术。蛋白质芯片技术是一种高通量分析方法，具有高效、快捷等优点。

探针蛋白点阵可特异地捕获样品中的靶蛋白并进行定性或定量分析。抗体芯片是蛋白质芯片中的主要类型，也是蛋白质芯片中发展最快的芯片，而且在技术上已经日益成熟，逐渐走向工业化的生产阶段。在一次实验中就能够平行地、高通量地同时比较几百种细胞中重要功能蛋白质的表达变化。

对乳腺癌诊断的意义

肿瘤标志物是肿瘤细胞区别于正常细胞的特征，其中包括基因和蛋白质。根据乳腺癌标志物的不同功能，主要分为早期诊断标志物和预后标志物。最初被用做乳腺癌预后标志物的是雌激素受体α，在乳腺癌组织中50％～55％有ER－α表达。

这一指标可以提示肿瘤是否是激素依赖型，并预示肿瘤对内分泌治疗的敏感性。目前仅发现了一些有可能用于肿瘤诊断的蛋白标志物，在被用于临床早期诊断的常规方法之前还需要进行大样本的验证。

蛋白质组模型分析主要是对蛋白质组模型进行分析而不是识别肿瘤生物标记物的来源。目前蛋白质组学研究主要集中在对乳腺导管原位癌和浸润性导管癌进行研究。