狼疮性肾炎的临床表现与病理改变之间有一定的联系。一般说来，正常肾小球和系膜性肾小球肾炎型临床表现较轻，可无尿异常，亦可表现为隐匿性肾炎；局灶节段增生性肾炎型多表现为隐匿性肾炎或慢性肾炎，少数可表现为肾病综合征；弥漫增生性肾炎型多表现为肾病综合征(约占75%)和慢性肾炎综合征；膜性狼疮性肾炎多表现为肾病综合征，但一般无明显高血压，肾功能恶化缓慢。
 
　　目前多数学者认为WHO 的组织学分型在狼疮性肾炎的治疗和预后判断中价值有限。但是，近年有一些学者认为肾组织活动性指数和慢性指数对治疗和预后判断有重要的指导价值。活动性指数是指由代表活动性(潜在可逆性)损害的那些项目的评分，相加成的一个总数，这些项目包括毛细血管内增生、白细胞浸润、毛细血管壁破坏、核固缩、细胞性新月体、白金耳、透明血栓、纤维素性血栓和纤维素沉积、间质细胞浸润、急性肾小管坏死、血管炎，按各项病变的轻、中、重分别评为1、2、3分。 

　　慢性指数是由慢性、硬化性、萎缩性和/或纤维化的评分相加成的一个总数，这些项目包括肾小球硬化、纤维素性新月体和粘连、间质硬化、肾小管萎缩、动脉和小动脉硬化，各项亦按轻、中、重分别评为1、2、3分。慢性指数与晚期肾脏病的程度呈正相关。活动指数轻度至中度升高提示病情有可逆性，经过适当的治疗，肾功能可好转或稳定。慢性指数中度升高而活动性指数中度升高，仍是治疗的强烈指征。活动性指数重度升高，是积极治疗的指征，但它反映肾小球结构有严重的活动性破坏，常可导致疤痕形成。