可出现深部感觉过敏，脾充血、肿大。食管与结肠的肥大和扩张，继之形成巨食管和巨结肠。病人进食和排便均感严重困难。

　　心脏病变为心肌炎，慢性锥虫病多表现为心脏增大、心肌损伤广泛，同时心脏结构发生异常，加之长期的心律失常或室壁瘤的存在，在疾病的晚期可出现充血性心力衰竭。心肌内可见心肌纤维化、心脏肥大、房室腔扩张、心尖部偶呈动脉瘤样突出与血栓形成。心尖部和心房内脱落的血栓可引起脑或肺栓塞，严重者发生猝死。

　　神经系统影响为弥漫性软脑膜炎，脑皮质充血和水肿，神经元变性，胶质细胞增生、木僵和典型的白天睡眠状态，病人表情淡漠，疲倦，行走曳足，眼脸下垂，白天易睡。严重者突然深度昏睡而倒下，甚至倒卧时仍保持坐立状态。